17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0806 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0806  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1244    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00357901  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1052  protein of unknown function DUF342  44.1 
 
 
642 aa  510  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.929442  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1150  hypothetical protein  41.83 
 
 
638 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216644  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1210  hypothetical protein  32.75 
 
 
634 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0632  hypothetical protein  32.58 
 
 
618 aa  306  7e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.111722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0891  hypothetical protein  34.13 
 
 
619 aa  280  5e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0821  hypothetical protein  34.13 
 
 
619 aa  280  7e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.864118  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1210  hypothetical protein  33.6 
 
 
619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0043  hypothetical protein  28.89 
 
 
623 aa  163  8.000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0082  hypothetical protein  28.38 
 
 
622 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0059  hypothetical protein  28.97 
 
 
622 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0507  hypothetical protein  26.39 
 
 
559 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  21.95 
 
 
611 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  27.69 
 
 
463 aa  53.9  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  24.16 
 
 
530 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  24.29 
 
 
653 aa  50.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  24.08 
 
 
459 aa  43.5  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>