16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3794 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3794  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 93 aa  186  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000207489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1617  hypothetical protein  38.1 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1716  hypothetical protein  38.1 
 
 		 218 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  35.06 
 
 		 396 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  34.69 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  41.51 
 
 		 443 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  48.65 
 
 		 225 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  38 
 
 		 409 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4743  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.34 
 
 		 573 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.258371  normal  0.341295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 		 307 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  37.93 
 
 		 462 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 413 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  43.9 
 
 		 410 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 1557 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  42.86 
 
 		 405 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2249  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 183 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>