40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2295 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2295  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  307  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0231589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0302  hypothetical protein  39 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.548464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  63.89 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0587  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3641  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.180921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3452  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
123 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4443  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3898  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 
126 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  35.29 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  58.33 
 
 
126 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0168  50S ribosomal protein L7/L12  38.46 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.640563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  71.43 
 
 
127 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0953  50S ribosomal protein L7/L12  36.96 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3438  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
124 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0316636  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0045  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1783  50S ribosomal protein L7/L12  76.92 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
125 aa  41.6  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1508  ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000145958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
124 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  62.86 
 
 
123 aa  41.6  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  75 
 
 
129 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  75 
 
 
128 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2263  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
124 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0097  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0101  50S ribosomal protein L7/L12  66.67 
 
 
122 aa  41.2  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000988391  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0041  50S ribosomal protein L7/L12  54.29 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0709556  hitchhiker  0.00000000000056539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  55.56 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0478  50S ribosomal protein L7/L12  76.92 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0463  50S ribosomal protein L7/L12  76.92 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.228162  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  62.86 
 
 
124 aa  40.8  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
124 aa  40.8  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  62.86 
 
 
124 aa  40.8  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0339  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.784286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  60 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0318  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00372625  normal  0.202232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2768  50S ribosomal protein L7/L12  57.14 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.549753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>