17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0667 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0667  Muconolactone delta-isomerase  100 
 
 		 103 aa  209  7.999999999999999e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1350  hypothetical protein  70.37 
 
 		 83 aa  124  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00108566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2432  putative translational initiation factor  39.36 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.113595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1849  hypothetical protein  35 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0857  putative transporter  33.01 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.342829  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1587  muconolactone delta-isomerase  32.61 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0277807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1502  muconolactone delta-isomerase  31.52 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165868  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1690  muconolactone delta-isomerase  33.7 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2118  muconolactone delta-isomerase  30.43 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1175  muconolactone delta-isomerase  30.43 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.986805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4877  muconolactone delta-isomerase  31.51 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.674817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0159  muconolactone delta-isomerase  27.78 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0141  muconolactone delta-isomerase  30.43 
 
 		 98 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2374  muconolactone delta-isomerase  32.61 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.288913  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3938  muconolactone delta-isomerase  31.51 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358097  normal  0.0505497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19210  muconolactone delta-isomerase  30.43 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.277055  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1426  muconolactone delta-isomerase  28.05 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  0.380314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>