101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3602 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
129 aa  260  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2649  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.59 
 
 
126 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000551252  normal  0.306748 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2046  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.17 
 
 
126 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.33743e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.79 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.66024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3163  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.07 
 
 
128 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0498  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  31.85 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0444  glyoxalase I  32.81 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0189  hypothetical protein  29.84 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.735348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0198  hypothetical protein  29.84 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00185  predicted lyase  29.03 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.931309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00184  hypothetical protein  29.03 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.883797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1663  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
126 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000363775  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3416  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.03 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0191  hypothetical protein  29.03 
 
 
129 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3473  hypothetical protein  29.03 
 
 
129 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.815895  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0180  hypothetical protein  29.03 
 
 
129 aa  53.9  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0197  hypothetical protein  29.03 
 
 
129 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.91 
 
 
128 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0725  hypothetical protein  29.84 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.542377  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0248  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.4 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.77 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5785  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.34 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932614  normal  0.0358814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3577  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.502389  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0273  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.381632 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0257  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0262  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.199971  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0276  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0257  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.74773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1334  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000474766  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2533  lactoylglutathione lyase  27.61 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42336  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.61 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  28.15 
 
 
128 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  28.36 
 
 
131 aa  47  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0521  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.41 
 
 
128 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2573  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.63 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149975  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  26.77 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0518  lactoylglutathione lyase (glyoxylase I)  27.41 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1024  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808514  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0380  lactoylglutathione lyase related lyase  26.56 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0158704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  30.37 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001198  glyoxylase family protein  25.78 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.34 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  29.82 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4693  glyoxylase family protein  27.01 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.133333  hitchhiker  0.000000000000906955 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6081  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0853  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000162872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1430  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.76 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2496  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  29.82 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0574  glyoxylase family protein  27.41 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  31.82 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0607  glyoxylase family protein  27.41 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.06 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  28.68 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  30 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.52 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0524594  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2291  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.42 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2034  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.42 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.422814  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  29.59 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  29.69 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  29.69 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  29.69 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  29.69 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  29.69 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  26.67 
 
 
136 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2304  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.866853  normal  0.0730884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0645  glyoxylase family protein  26.28 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  28.03 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.62 
 
 
128 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  29.01 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  31.9 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  31.01 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 
140 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  28.46 
 
 
130 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.28 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2478  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  30.53 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  31.53 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  27.27 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  29.46 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  27.14 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0958  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.19 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  30.23 
 
 
238 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1979  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
126 aa  40.8  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  28.46 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1849  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.863328  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3065  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.23 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.656499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1648  methylmalonyl-CoA epimerase  28.67 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.622175 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>