119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3455 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3455  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  313  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3678  GCN5-related N-acetyltransferase  85.82 
 
 
143 aa  255  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.033245  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2909  GCN5-related N-acetyltransferase  78.1 
 
 
137 aa  231  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2504  acetyltransferase  54.74 
 
 
137 aa  173  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  59.85 
 
 
137 aa  173  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.202687  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3831  acetyltransferase  59.12 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0771  pantoate--beta-alanine ligase  59.12 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  59.12 
 
 
137 aa  171  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  57.66 
 
 
137 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3612  GCN5-related N-acetyltransferase  56.93 
 
 
137 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0398912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  56.93 
 
 
137 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.158588  hitchhiker  0.0000269359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0699  GCN5-related N-acetyltransferase  56.2 
 
 
137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0805  GCN5-related N-acetyltransferase  56.52 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0641  GCN5-related N-acetyltransferase  62.63 
 
 
101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1100  acetyltransferase  50.36 
 
 
139 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.219488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1622  GCN5-related N-acetyltransferase  37.96 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1261  putative acetyltransferase  36.03 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2063  putative acetyltransferase  36.23 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.297945  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1453  putative acetyltransferase  36.23 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0558082  normal  0.748817 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2003  putative acetyltransferase  35.29 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0041  GCN5-related N-acetyltransferase  44.79 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.875009  normal  0.791759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2607  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.316995  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0771  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  0.015277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2834  acetyltransferase  34.68 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2616  acetyltransferase  34.68 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2533  acetyltransferase  34.68 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0469646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2807  acetyltransferase  34.68 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.559346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2855  acetyltransferase, GNAT family  34.68 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000655313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2814  acetyltransferase, GNAT family  34.68 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2565  acetyltransferase  34.68 
 
 
138 aa  85.5  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00541048  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3446  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4921  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
181 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5366  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0543291  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2697  acetyltransferase, gnat family  32.31 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000437852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1003  acetyltransferase, GNAT family  40.57 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0377397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2458  acetyltransferase  32.31 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000129443  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05434  acetyltransferase  42.71 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0391  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2274  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2478  acetyltransferase  33.87 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0345  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000750297  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2704  acetyltransferase  31.82 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  36.61 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.229217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404954  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3329  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.493254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0869  GCN5-related N-acetyltransferase  40.57 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2702  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.651108  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397048  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2748  acetyltransferase, gnat family  30.77 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2812  acetyltransferase  33.06 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2809  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344932  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0774  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3474  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2606  acetyltransferase  31.06 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3665  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4777  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3390  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4126  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0708  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011178  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2489  acetyltransferase  40.62 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1378  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2717  acetyltransferase  30.34 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3386  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1611  GCN5-related N-acetyltransferase  40.57 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00842195  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1182  GCN5-related N-acetyltransferase  37.62 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183089  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3499  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3060  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.128567 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1282  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2796  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3203  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3571  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3236  acetyltransferase  37.82 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2458  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0330928  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0121  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  38 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3235  acetyltransferase  38.14 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.815213  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1697  acetyltransferase  32.2 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001443  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1544  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530113  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6056  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0119  hypothetical protein  34.34 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1576  hypothetical protein  32.99 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1764  Histone acetyltransferase protein  36.46 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1873  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101934  normal  0.109288 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0070  hypothetical protein  29.85 
 
 
494 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1697  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
143 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0725015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2449  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
57 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0774  GCN5-related N-acetyltransferase  47.27 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.60492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
136 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695206  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0127  hypothetical protein  26.36 
 
 
391 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2004  acetyltransferase, GNAT family  38.71 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>