64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2449 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2449  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
57 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2702  GCN5-related N-acetyltransferase  67.86 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.651108  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0708  GCN5-related N-acetyltransferase  66.07 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1182  GCN5-related N-acetyltransferase  62.5 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183089  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  66.04 
 
 
181 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3386  GCN5-related N-acetyltransferase  61.11 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1378  GCN5-related N-acetyltransferase  57.14 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  58.93 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3474  GCN5-related N-acetyltransferase  58.93 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0774  GCN5-related N-acetyltransferase  58.93 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3665  GCN5-related N-acetyltransferase  58.93 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0771  GCN5-related N-acetyltransferase  46.3 
 
 
141 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  0.015277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.229217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000750297  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5366  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
141 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0543291  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4921  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
141 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3329  GCN5-related N-acetyltransferase  48.15 
 
 
144 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.493254 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3446  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
141 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4777  GCN5-related N-acetyltransferase  50.98 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4126  GCN5-related N-acetyltransferase  50.98 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3390  GCN5-related N-acetyltransferase  50.98 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3455  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  50.98 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2809  GCN5-related N-acetyltransferase  49.02 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344932  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3678  GCN5-related N-acetyltransferase  44.23 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.033245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3499  GCN5-related N-acetyltransferase  46 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3203  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1003  acetyltransferase, GNAT family  38.18 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0377397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1697  acetyltransferase  44.44 
 
 
142 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3612  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
137 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0398912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0699  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0869  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
137 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.158588  hitchhiker  0.0000269359 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0119  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3831  acetyltransferase  41.18 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3571  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0805  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1100  acetyltransferase  42.86 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.219488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2909  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2458  acetyltransferase  34.55 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000129443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2697  acetyltransferase, gnat family  34.55 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000437852 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0771  pantoate--beta-alanine ligase  39.22 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.202687  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2748  acetyltransferase, gnat family  32.73 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0641  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0519  hypothetical protein  43.4 
 
 
111 aa  43.5  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2458  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0330928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2704  acetyltransferase  32.73 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2606  acetyltransferase  32.73 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124368 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3235  acetyltransferase  35.71 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.815213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2504  acetyltransferase  38.18 
 
 
137 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139455  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1066  hypothetical protein  42.31 
 
 
216 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0983  hypothetical protein  42.31 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0391  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1576  hypothetical protein  37.25 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2003  putative acetyltransferase  35.71 
 
 
139 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1261  putative acetyltransferase  35.19 
 
 
145 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2607  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
138 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.316995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>