123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2909 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2909  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
137 aa  283  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3678  GCN5-related N-acetyltransferase  81.95 
 
 
143 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.033245  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3455  GCN5-related N-acetyltransferase  78.1 
 
 
151 aa  231  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2504  acetyltransferase  54.01 
 
 
137 aa  177  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139455  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  54.74 
 
 
137 aa  169  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.202687  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  54.74 
 
 
137 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0771  pantoate--beta-alanine ligase  54.74 
 
 
137 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3831  acetyltransferase  54.01 
 
 
137 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3612  GCN5-related N-acetyltransferase  52.55 
 
 
137 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0398912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  53.28 
 
 
137 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3544  GCN5-related N-acetyltransferase  52.55 
 
 
137 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.158588  hitchhiker  0.0000269359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0805  GCN5-related N-acetyltransferase  53.28 
 
 
139 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0699  GCN5-related N-acetyltransferase  51.82 
 
 
137 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1100  acetyltransferase  52.21 
 
 
139 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.219488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0641  GCN5-related N-acetyltransferase  59.6 
 
 
101 aa  139  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101205  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1261  putative acetyltransferase  38.24 
 
 
145 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1622  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
139 aa  104  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0118317 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2003  putative acetyltransferase  37.5 
 
 
139 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2063  putative acetyltransferase  36.76 
 
 
145 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.297945  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1453  putative acetyltransferase  36.76 
 
 
145 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0558082  normal  0.748817 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0041  GCN5-related N-acetyltransferase  44.79 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.875009  normal  0.791759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3446  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146692  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4921  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0522676 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5366  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0543291  normal  0.122741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0391  GCN5-related N-acetyltransferase  36.03 
 
 
142 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3329  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
144 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.493254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0771  GCN5-related N-acetyltransferase  35.97 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  0.015277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5167  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4192  GCN5-related N-acetyltransferase  35.77 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2834  acetyltransferase  32.28 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124056  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4777  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3390  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2274  GCN5-related N-acetyltransferase  38.54 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4126  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516521 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2809  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344932  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2855  acetyltransferase, GNAT family  32.28 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000655313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2478  acetyltransferase  33.86 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0345  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786873 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05434  acetyltransferase  32.87 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2697  acetyltransferase, gnat family  31.01 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000437852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2616  acetyltransferase  31.5 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2533  acetyltransferase  31.5 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0469646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2807  acetyltransferase  31.5 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.559346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2814  acetyltransferase, GNAT family  31.5 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2458  acetyltransferase  31.01 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000129443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2565  acetyltransferase  31.5 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00541048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2607  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.316995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2717  acetyltransferase  29.08 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3499  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  38.14 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000750297  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2748  acetyltransferase, gnat family  30.23 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000064412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2704  acetyltransferase  31.01 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2812  acetyltransferase  31.5 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.229217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2702  GCN5-related N-acetyltransferase  36.27 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.651108  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0708  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 
150 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1611  GCN5-related N-acetyltransferase  34.53 
 
 
143 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00842195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2489  acetyltransferase  30.61 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1697  acetyltransferase  32.37 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1378  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2606  acetyltransferase  30.23 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1003  acetyltransferase, GNAT family  31.91 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3571  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2796  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1182  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183089  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1588  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.011178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0869  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0774  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3665  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3474  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0121  hypothetical protein  25.93 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3386  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2458  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0330928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3060  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.128567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3203  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1282  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3236  acetyltransferase  38.4 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315203  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4849  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1764  Histone acetyltransferase protein  38.3 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1544  GCN5-related N-acetyltransferase  30.15 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530113  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001443  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1873  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.101934  normal  0.109288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6056  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3235  acetyltransferase  35.05 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.815213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695206  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0070  hypothetical protein  32 
 
 
494 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.988819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1576  hypothetical protein  30.93 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0119  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0774  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.60492  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0127  hypothetical protein  22.61 
 
 
391 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1697  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0725015 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.9 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2762  GCN5-related N-acetyltransferase  25.2 
 
 
153 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.123126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>