16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0143 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0143  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  359  9e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0122  hypothetical protein  57.34 
 
 		 169 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4258  hypothetical protein  42.33 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0122  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0085  hypothetical protein  54.07 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4394  hypothetical protein  41.27 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4219  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4067  hypothetical protein  46.71 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4053  hypothetical protein  48.19 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4701  hypothetical protein  48.98 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3844  hypothetical protein  51.43 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3937  hypothetical protein  51.43 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3659  hypothetical protein  47.79 
 
 		 180 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.694954  normal  0.701609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3544  hypothetical protein  38.93 
 
 		 201 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3593  hypothetical protein  38.03 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3876  hypothetical protein  35.46 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>