16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3876 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0143  hypothetical protein  35.46 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0122  hypothetical protein  36.43 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  87.8  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.694954  normal  0.701609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0122  hypothetical protein  27.81 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4067  hypothetical protein  36.29 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4219  hypothetical protein  27.81 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4394  hypothetical protein  27.81 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3544  hypothetical protein  31.74 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4258  hypothetical protein  27.27 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3844  hypothetical protein  31.74 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3937  hypothetical protein  31.74 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4701  hypothetical protein  33.83 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3593  hypothetical protein  39.78 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4053  hypothetical protein  28.81 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>