16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3544 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3544  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  413  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0085  hypothetical protein  46.4 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0122  hypothetical protein  43.41 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4219  hypothetical protein  41.86 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4394  hypothetical protein  42.64 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0122  hypothetical protein  42.19 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0143  hypothetical protein  38.93 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.196564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4258  hypothetical protein  41.86 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3844  hypothetical protein  47.58 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3937  hypothetical protein  47.58 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4701  hypothetical protein  44.88 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4053  hypothetical protein  43.18 
 
 		 171 aa  98.6  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4067  hypothetical protein  38.58 
 
 		 160 aa  97.8  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3659  hypothetical protein  43.51 
 
 		 180 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.694954  normal  0.701609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3876  hypothetical protein  31.74 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3593  hypothetical protein  36.57 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>