25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6244 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6244  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  317  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92011  normal  0.196222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22570  hypothetical protein  51.49 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1960  hypothetical protein  41.35 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22060  hypothetical protein  55.81 
 
 
131 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.873506  normal  0.803324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1812  hypothetical protein  55.56 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00409848  normal  0.984143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1727  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2849  hypothetical protein  27.78 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.06638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2558  hypothetical protein  27.78 
 
 
128 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0203867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2808  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2526  hypothetical protein  26.98 
 
 
128 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0224224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2805  hypothetical protein  26.98 
 
 
128 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000854588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2604  hypothetical protein  27.34 
 
 
128 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.371628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2797  hypothetical protein  27.2 
 
 
131 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2607  hypothetical protein  27.2 
 
 
131 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2374  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  46.67 
 
 
495 aa  47.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2482  YjgA  26.19 
 
 
128 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.881473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2829  hypothetical protein  26.98 
 
 
128 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5052  hypothetical protein  37.62 
 
 
132 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1379  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4007  hypothetical protein  36.11 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.471285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3324  hypothetical protein  23.31 
 
 
134 aa  44.3  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491897  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2405  hypothetical protein  22.06 
 
 
133 aa  44.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2916  hypothetical protein  26.67 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.670109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1549  hypothetical protein  28.93 
 
 
128 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2981  hypothetical protein  37.61 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.371839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>