11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4953 on replicon NC_009829
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009829  Spro_4953  replication initiation protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.368158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0067  replication protein  31.67 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.434095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0089  replication protein  31.55 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0283  replication protein  32.02 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232137  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0002  replication protein  31.55 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0037  replication protein  30.69 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0078  replication protein  31.53 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0025  replication protein  33.78 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0002  replication initiation protein  25.96 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0047  replication initiation protein  25.96 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0286778  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4311  hypothetical protein  23.08 
 
 		 339 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0357333  hitchhiker  0.000782423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>