28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2087 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2087  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6819  hypothetical protein  31.62 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.309347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2334  hypothetical protein  27.33 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000762456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4264  twin-arginine translocation pathway signal  30.49 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.124432  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3800  sorbitol dehydrogenase small subunit  27.38 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4443  hypothetical protein  29.27 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3979  hypothetical protein  29.27 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0267331 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6550  twin-arginine translocation pathway signal  28.49 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1292  hypothetical protein  28.74 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5750  hypothetical protein  28.48 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1161  hypothetical protein  29.92 
 
 		 218 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0718  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  29.23 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4554  hypothetical protein  28.66 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3814  twin-arginine translocation pathway signal  28.66 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1809  putative dehydrogenase subunit  28.46 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000170346  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4093  hypothetical protein  27.88 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0788  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  29.23 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0770  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  29.5 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281995  normal  0.0583116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7346  hypothetical protein  28.09 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235414  normal  0.777763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1416  oxidoreductase, putative  26.04 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1348  putative glucose dehydrogenase, gamma subunit  25.61 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.79773  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1082  putative oxidoreductase  25.61 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0653226  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1433  putative glucose dehydrogenase, gamma subunit  25.61 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0490  putative oxidoreductase  25.61 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169791  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0217  putative oxidoreductase  25.61 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2588  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  25.61 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1246  putative oxidoreductase  31.15 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26990  hypothetical protein  25.29 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>