24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4264 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4264  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.124432  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6819  hypothetical protein  36.8 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.309347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2334  hypothetical protein  30.11 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000762456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1161  hypothetical protein  32.85 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2087  twin-arginine translocation pathway signal  30.49 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3814  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92444  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4554  hypothetical protein  30.65 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5750  hypothetical protein  30.65 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1809  putative dehydrogenase subunit  31.25 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000170346  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1292  hypothetical protein  33.93 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3979  hypothetical protein  33.72 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0267331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4443  hypothetical protein  33.72 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6550  twin-arginine translocation pathway signal  32.09 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26990  hypothetical protein  29.55 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5693  hypothetical protein  29.27 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110569 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0718  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  32.12 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3757  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4611  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0215905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0770  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  28.16 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281995  normal  0.0583116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0788  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  31.71 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4093  hypothetical protein  31.4 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3800  sorbitol dehydrogenase small subunit  27.88 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7346  hypothetical protein  28.65 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235414  normal  0.777763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1416  oxidoreductase, putative  27.78 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>