31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1292 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1292  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890635  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3814  twin-arginine translocation pathway signal  94.65 
 
 
200 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92444  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4554  hypothetical protein  94.65 
 
 
200 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6550  twin-arginine translocation pathway signal  95.27 
 
 
178 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5750  hypothetical protein  94.05 
 
 
168 aa  322  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4093  hypothetical protein  90.48 
 
 
168 aa  313  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53209  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3979  hypothetical protein  91.07 
 
 
168 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0267331 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4443  hypothetical protein  91.07 
 
 
168 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2588  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  74.27 
 
 
171 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1082  putative oxidoreductase  74.27 
 
 
171 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0653226  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1348  putative glucose dehydrogenase, gamma subunit  74.27 
 
 
171 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.79773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0217  putative oxidoreductase  74.27 
 
 
171 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0490  putative oxidoreductase  74.27 
 
 
171 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169791  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1433  putative glucose dehydrogenase, gamma subunit  74.27 
 
 
171 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1416  oxidoreductase, putative  72.51 
 
 
171 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1246  putative oxidoreductase  78.95 
 
 
134 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0718  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  61.11 
 
 
161 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0788  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  58.68 
 
 
161 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0770  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  55.36 
 
 
163 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281995  normal  0.0583116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6819  hypothetical protein  38.69 
 
 
197 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.309347 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7346  hypothetical protein  34.22 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235414  normal  0.777763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26990  hypothetical protein  35.25 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4264  twin-arginine translocation pathway signal  33.93 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.124432  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2334  hypothetical protein  29.27 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000762456  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2087  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1809  putative dehydrogenase subunit  28.22 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000170346  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1161  hypothetical protein  31.09 
 
 
218 aa  57.8  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3800  sorbitol dehydrogenase small subunit  24.28 
 
 
209 aa  54.7  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4611  hypothetical protein  29.23 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0215905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3757  hypothetical protein  29.23 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5693  hypothetical protein  29.23 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0110569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>