31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0788 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0788  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  100 
 
 		 161 aa  320  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.202224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0718  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  94.41 
 
 		 161 aa  275  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0770  putative transmembrane dehydrogenase (small subunit) oxidoreductase protein  75.16 
 
 		 163 aa  219  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.281995  normal  0.0583116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4093  hypothetical protein  60.62 
 
 		 168 aa  187  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6550  twin-arginine translocation pathway signal  63.33 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1292  hypothetical protein  58.68 
 
 		 187 aa  181  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.890635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4443  hypothetical protein  58.08 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3979  hypothetical protein  58.08 
 
 		 168 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0267331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5750  hypothetical protein  60 
 
 		 168 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3814  twin-arginine translocation pathway signal  60 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92444  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4554  hypothetical protein  60 
 
 		 200 aa  177  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1433  putative glucose dehydrogenase, gamma subunit  60.87 
 
 		 171 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1082  putative oxidoreductase  60.87 
 
 		 171 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0653226  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1348  putative glucose dehydrogenase, gamma subunit  60.87 
 
 		 171 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.79773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0217  putative oxidoreductase  60.87 
 
 		 171 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0490  putative oxidoreductase  60.87 
 
 		 171 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169791  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2588  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  60.87 
 
 		 171 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1416  oxidoreductase, putative  60.87 
 
 		 171 aa  173  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1246  putative oxidoreductase  60.15 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6819  hypothetical protein  36.62 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.309347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2334  hypothetical protein  32.52 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000762456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26990  hypothetical protein  39.34 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7346  hypothetical protein  40.62 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235414  normal  0.777763 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3800  sorbitol dehydrogenase small subunit  32.08 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.467679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4264  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.124432  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1809  putative dehydrogenase subunit  31.29 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000170346  hitchhiker  0.0000324961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2087  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3757  hypothetical protein  32.43 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4611  hypothetical protein  32.43 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0215905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5693  hypothetical protein  33.11 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>