28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4492 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4492  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  287  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  normal  0.0496662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5511  hypothetical protein  67.15 
 
 
147 aa  178  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.032178  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1217  hypothetical protein  59.57 
 
 
147 aa  156  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3375  hypothetical protein  56.52 
 
 
148 aa  147  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0365  hypothetical protein  56.92 
 
 
150 aa  140  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3557  hypothetical protein  56.8 
 
 
207 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3494  hypothetical protein  56.8 
 
 
207 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3507  hypothetical protein  56.8 
 
 
203 aa  140  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3882  hypothetical protein  52.14 
 
 
206 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2672  hypothetical protein  50.7 
 
 
203 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.975237 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2795  hypothetical protein  54.29 
 
 
205 aa  132  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12433  hypothetical protein  53.23 
 
 
200 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.268216  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3179  hypothetical protein  53.57 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1978  hypothetical protein  52.85 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000303901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2241  hypothetical protein  49.18 
 
 
193 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3690  hypothetical protein  53.28 
 
 
125 aa  120  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2222  hypothetical protein  52.03 
 
 
205 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.440817  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1555  hypothetical protein  53.21 
 
 
183 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3034  hypothetical protein  45.7 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13320  hypothetical protein  52.99 
 
 
193 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1741  hypothetical protein  49.18 
 
 
183 aa  113  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1890  hypothetical protein  44.92 
 
 
158 aa  106  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4140  hypothetical protein  46.15 
 
 
179 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000389014  hitchhiker  0.000257771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2206  hypothetical protein  44.72 
 
 
175 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17380  hypothetical protein  41.61 
 
 
216 aa  100  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12420  hypothetical protein  48.6 
 
 
220 aa  100  9e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0326175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0553  hypothetical protein  46.72 
 
 
205 aa  84.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3631  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.32 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>