28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3690 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3690  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  243  8e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2222  hypothetical protein  74.38 
 
 
205 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.440817  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1741  hypothetical protein  65.57 
 
 
183 aa  164  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3034  hypothetical protein  65.87 
 
 
188 aa  153  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13320  hypothetical protein  67.54 
 
 
193 aa  148  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2241  hypothetical protein  57.38 
 
 
193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608581  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2206  hypothetical protein  64.66 
 
 
175 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445851  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0553  hypothetical protein  67.21 
 
 
205 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1978  hypothetical protein  59.84 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000303901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17380  hypothetical protein  55.56 
 
 
216 aa  134  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3882  hypothetical protein  52.03 
 
 
206 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1555  hypothetical protein  57.76 
 
 
183 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5511  hypothetical protein  51.64 
 
 
147 aa  120  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.032178  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4492  hypothetical protein  53.28 
 
 
144 aa  120  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  normal  0.0496662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2672  hypothetical protein  51.22 
 
 
203 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.975237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3557  hypothetical protein  52.03 
 
 
207 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3494  hypothetical protein  52.03 
 
 
207 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3507  hypothetical protein  52.03 
 
 
203 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0365  hypothetical protein  52.1 
 
 
150 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12433  hypothetical protein  53.78 
 
 
200 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.268216  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3179  hypothetical protein  53.23 
 
 
140 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2795  hypothetical protein  52.1 
 
 
205 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3375  hypothetical protein  52.5 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12420  hypothetical protein  53.57 
 
 
220 aa  108  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0326175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1217  hypothetical protein  48.78 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1890  hypothetical protein  49.57 
 
 
158 aa  106  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4140  hypothetical protein  43.48 
 
 
179 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000389014  hitchhiker  0.000257771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13020  hypothetical protein  26.5 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.030115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>