27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3557 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3494  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  413  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3557  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  413  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3507  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3882  hypothetical protein  70.48 
 
 
206 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2672  hypothetical protein  70.79 
 
 
203 aa  278  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.975237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12433  hypothetical protein  64.08 
 
 
200 aa  265  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.268216  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2795  hypothetical protein  51.85 
 
 
205 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3179  hypothetical protein  63.04 
 
 
140 aa  161  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5511  hypothetical protein  55.63 
 
 
147 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.032178  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4492  hypothetical protein  56.8 
 
 
144 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  normal  0.0496662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0365  hypothetical protein  52.67 
 
 
150 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725629  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1978  hypothetical protein  58.68 
 
 
187 aa  137  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000303901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2241  hypothetical protein  52.46 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13320  hypothetical protein  58.62 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3375  hypothetical protein  53.49 
 
 
148 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1217  hypothetical protein  49.31 
 
 
147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1741  hypothetical protein  48.59 
 
 
183 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2222  hypothetical protein  53.28 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.440817  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1555  hypothetical protein  57.8 
 
 
183 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3034  hypothetical protein  46.2 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2206  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3690  hypothetical protein  52.03 
 
 
125 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4140  hypothetical protein  46.62 
 
 
179 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000389014  hitchhiker  0.000257771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1890  hypothetical protein  52.54 
 
 
158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17380  hypothetical protein  47.1 
 
 
216 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12420  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0326175  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0553  hypothetical protein  43.12 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>