27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4140 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4140  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  354  5e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000389014  hitchhiker  0.000257771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1890  hypothetical protein  54.23 
 
 
158 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3494  hypothetical protein  46.62 
 
 
207 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3557  hypothetical protein  46.62 
 
 
207 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.575038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2206  hypothetical protein  43.86 
 
 
175 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3507  hypothetical protein  46.62 
 
 
203 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3882  hypothetical protein  49.58 
 
 
206 aa  114  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13320  hypothetical protein  44.2 
 
 
193 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1978  hypothetical protein  44.59 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000303901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1217  hypothetical protein  45.08 
 
 
147 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12433  hypothetical protein  49.17 
 
 
200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.268216  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3034  hypothetical protein  45.91 
 
 
188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2672  hypothetical protein  48.74 
 
 
203 aa  111  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.975237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2222  hypothetical protein  42.58 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.440817  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2795  hypothetical protein  50 
 
 
205 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3179  hypothetical protein  47.97 
 
 
140 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3375  hypothetical protein  45.83 
 
 
148 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4492  hypothetical protein  46.15 
 
 
144 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  normal  0.0496662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2241  hypothetical protein  43.2 
 
 
193 aa  104  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1741  hypothetical protein  45.32 
 
 
183 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12420  hypothetical protein  46.04 
 
 
220 aa  101  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0326175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17380  hypothetical protein  43.7 
 
 
216 aa  101  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0365  hypothetical protein  43.75 
 
 
150 aa  97.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725629  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1555  hypothetical protein  47.27 
 
 
183 aa  94  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5511  hypothetical protein  41.53 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.032178  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3690  hypothetical protein  43.48 
 
 
125 aa  88.2  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0553  hypothetical protein  37.7 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>