27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13320  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.164201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2206  hypothetical protein  58.66 
 
 		 175 aa  191  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.445851  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1555  hypothetical protein  51.63 
 
 		 183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2241  hypothetical protein  53.7 
 
 		 193 aa  164  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608581  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2222  hypothetical protein  56.1 
 
 		 205 aa  160  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.440817  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1978  hypothetical protein  54.3 
 
 		 187 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000303901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3034  hypothetical protein  62.31 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3690  hypothetical protein  67.54 
 
 		 125 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1741  hypothetical protein  59.02 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0553  hypothetical protein  54.14 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12420  hypothetical protein  57.04 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0326175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2672  hypothetical protein  59.66 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215871  normal  0.975237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12433  hypothetical protein  57.98 
 
 		 200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.268216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3882  hypothetical protein  54.55 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3494  hypothetical protein  58.62 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3507  hypothetical protein  58.62 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.805269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3557  hypothetical protein  58.62 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.575038 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17380  hypothetical protein  50.38 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5511  hypothetical protein  52.14 
 
 		 147 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.032178  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4492  hypothetical protein  52.99 
 
 		 144 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  normal  0.0496662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4140  hypothetical protein  44.2 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000389014  hitchhiker  0.000257771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2795  hypothetical protein  51.67 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1890  hypothetical protein  50.4 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1217  hypothetical protein  52.94 
 
 		 147 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3179  hypothetical protein  52.07 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3375  hypothetical protein  49.59 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0365  hypothetical protein  46.55 
 
 		 150 aa  102  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.725629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>