18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2158 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2158  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  703    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4193  hypothetical protein  24 
 
 
357 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.216896  normal  0.0145048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5312  hypothetical protein  27.99 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1765  hypothetical protein  23.77 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2140  hypothetical protein  25.33 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.931456  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4321  hypothetical protein  23.31 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  0.426032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0596  hypothetical protein  23.9 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6005  hypothetical protein  24.56 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000294758  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5773  hypothetical protein  23.61 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0552944  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6046  hypothetical protein  22.27 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0106  hypothetical protein  19.07 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  0.514642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5825  hypothetical protein  27.59 
 
 
371 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1389  hypothetical protein  19.84 
 
 
347 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4913  hypothetical protein  22.88 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4159  hypothetical protein  23.83 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.616827  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1491  hypothetical protein  26.72 
 
 
311 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0510  hypothetical protein  23.73 
 
 
473 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749125  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4789  hypothetical protein  26.02 
 
 
548 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.14919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>