16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2140 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2140  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  733    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.931456  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4193  hypothetical protein  36.89 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.216896  normal  0.0145048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4321  hypothetical protein  33.91 
 
 
343 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650339  normal  0.426032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5312  hypothetical protein  30.98 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1389  hypothetical protein  23.36 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2158  hypothetical protein  26.01 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5773  hypothetical protein  29.04 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0552944  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6005  hypothetical protein  27.81 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000294758  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1765  hypothetical protein  34.21 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0106  hypothetical protein  24.62 
 
 
339 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  0.514642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0596  hypothetical protein  25.68 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4159  hypothetical protein  21.71 
 
 
288 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.616827  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0510  hypothetical protein  27.02 
 
 
473 aa  46.6  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749125  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4913  hypothetical protein  22.55 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.641097  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0878  hypothetical protein  26.86 
 
 
421 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.747896  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1491  hypothetical protein  25.14 
 
 
311 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>