More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_R0050 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_R0028  23S ribosomal RNA  91.2 
 
 		 2925 bp  1681    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0156904  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0018  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2904 bp  5757    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0004  23S ribosomal RNA  91.2 
 
 		 2925 bp  1681    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180219  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0050  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2904 bp  5757    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0056  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2904 bp  5757    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0055  23S ribosomal RNA  91.2 
 
 		 2925 bp  1681    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0023  23S ribosomal RNA  91.2 
 
 		 2925 bp  1681    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0220545  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0012  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 2906 bp  5729    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0036  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2904 bp  5757    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r0554  23S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 2901 bp  460  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2177  23S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 2901 bp  460  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2449  23S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 2901 bp  460  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2492  23S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 2901 bp  460  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2570  23S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 2901 bp  460  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_r2607  23S ribosomal RNA  85.9 
 
 		 2901 bp  460  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0049  23S ribosomal RNA  86.1 
 
 		 2956 bp  454  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0054  23S ribosomal RNA  86.1 
 
 		 2956 bp  454  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175608  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0411  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 2902 bp  450  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0063  23S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 2924 bp  448  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00771367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0183  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 2902 bp  450  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0025  23S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 2925 bp  448  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.610781  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0010  23S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 2925 bp  448  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r1782  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 2901 bp  450  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0170  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 2902 bp  450  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0078  23S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 2925 bp  448  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0049  23S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 2925 bp  448  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0004  23S ribosomal RNA  85.35 
 
 		 2925 bp  448  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545462  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0081  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 2902 bp  450  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_r0021  23S ribosomal RNA  85.61 
 
 		 2902 bp  450  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0011  23S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 3529 bp  450  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0016  23S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 3088 bp  450  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0021  23S ribosomal RNA  85.85 
 
 		 3260 bp  450  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0059  23S ribosomal RNA  86.1 
 
 		 3147 bp  446  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06920  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 3113 bp  444  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10560  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 3113 bp  444  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491594  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0062  23S ribosomal RNA  86.1 
 
 		 3147 bp  446  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0052  23S ribosomal RNA  86.1 
 
 		 3147 bp  446  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37130  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 3113 bp  444  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.756619  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0016  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 3108 bp  444  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0026  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 3108 bp  444  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0909246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22210  23S ribosomal RNA  85.45 
 
 		 3113 bp  444  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790169  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0024  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 3102 bp  444  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.105103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0043  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 3102 bp  444  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.595466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0048  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 3102 bp  444  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0066  23S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 3102 bp  444  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0035  23S ribosomal RNA  86.1 
 
 		 3147 bp  446  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03870  23S ribosomal RNA  85.66 
 
 		 3093 bp  438  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.322045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r0655  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2888 bp  440  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_r1371  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2888 bp  440  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r0450  23S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 2632 bp  440  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.226128 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1565  23S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 2631 bp  440  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1584  23S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 2631 bp  440  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1619  23S ribosomal RNA  85.55 
 
 		 2631 bp  440  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.20169 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SA  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2922 bp  434  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SB  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2922 bp  434  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0486187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SC  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2922 bp  434  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SD  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2922 bp  434  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SE  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2922 bp  434  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se23SF  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2922 bp  434  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0018  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.193918  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0064  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SA  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2903 bp  434  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SB  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2903 bp  434  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SC  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2903 bp  434  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SD  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2903 bp  434  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.635021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SE  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2903 bp  434  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.651063  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SF  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2903 bp  434  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  Sa23SG  23S ribosomal RNA  85.23 
 
 		 2903 bp  434  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0006  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0069  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0069  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0022  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0021  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1706  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 2914 bp  434  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0019  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0080  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0064  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.65244  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0006  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0080  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 2923 bp  434  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1833  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 2914 bp  434  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0021  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 2914 bp  434  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0165  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 2914 bp  434  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0011  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2933 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0062  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2932 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0118  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2933 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0004  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2933 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0027  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2933 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.373876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0016  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2933 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0203947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0099  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2933 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00331289  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0059  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2935 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0054  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2933 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0030  23S ribosomal RNA  85.13 
 
 		 2933 bp  432  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1798  23S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 2631 bp  432  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.25169e-21 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_r1804  23S ribosomal RNA  85.36 
 
 		 2631 bp  432  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000784168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0035  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 3125 bp  428  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0079  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 3125 bp  428  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0030  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 3124 bp  428  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0018  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 3125 bp  428  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14280  23S ribosomal RNA  85.47 
 
 		 3093 bp  430  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0043021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0055  23S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 3125 bp  428  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0180695  normal  0.232411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>