16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5933 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5933  Cbb3-type cytochrome oxidase component  100 
 
 		 50 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404492  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6266  Cbb3-type cytochrome oxidase component  100 
 
 		 50 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496314  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4960  Cbb3-type cytochrome oxidase component  72 
 
 		 50 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.779194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5017  Cbb3-type cytochrome oxidase component  68 
 
 		 50 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2094  cytochrome c oxidase FixQ chain  67.35 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.064575  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0467  Cbb3-type cytochrome oxidase component  61.7 
 
 		 52 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000540469  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  55.32 
 
 		 52 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0377  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, CcoQ subunit  55.32 
 
 		 52 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0536  Cbb3-type cytochrome oxidase component  53.49 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.150564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0694  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoQ subunit  51.16 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2349  Cbb3-type cytochrome oxidase component  51.16 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337464  normal  0.494297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2576  Cbb3-type cytochrome oxidase component  43.75 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.973883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3855  Cbb3-type cytochrome oxidase component  38 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2543  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915111  normal  0.769847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3661  Cbb3-type cytochrome oxidase component  44 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.678332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0461  Cbb3-type cytochrome oxidase component  41.18 
 
 		 53 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150757  normal  0.103304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>