15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0467 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0467  Cbb3-type cytochrome oxidase component  100 
 
 
52 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000540469  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  80.77 
 
 
52 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0377  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, CcoQ subunit  80.77 
 
 
52 aa  92.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5017  Cbb3-type cytochrome oxidase component  65.96 
 
 
50 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4960  Cbb3-type cytochrome oxidase component  63.83 
 
 
50 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.779194  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5933  Cbb3-type cytochrome oxidase component  61.7 
 
 
50 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404492  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6266  Cbb3-type cytochrome oxidase component  61.7 
 
 
50 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496314  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2094  cytochrome c oxidase FixQ chain  51.06 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.064575  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0694  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoQ subunit  44.9 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2349  Cbb3-type cytochrome oxidase component  44.9 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337464  normal  0.494297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3855  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.86 
 
 
69 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0536  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.86 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.150564  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2576  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.55 
 
 
56 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.973883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3661  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.55 
 
 
50 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.678332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2543  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915111  normal  0.769847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>