19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3661 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3661  Cbb3-type cytochrome oxidase component  100 
 
 		 50 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.678332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2439  Cbb3-type cytochrome oxidase component  52.08 
 
 		 52 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0735007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3272  Cbb3-type cytochrome oxidase component  56.25 
 
 		 49 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.348375  normal  0.349252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1151  Cbb3-type cytochrome oxidase component  55.32 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.340113  normal  0.0945912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0461  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50.98 
 
 		 53 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150757  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4960  Cbb3-type cytochrome oxidase component  50 
 
 		 50 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.779194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0018  Cbb3-type cytochrome oxidase component  52.17 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1530  Cbb3-type cytochrome oxidase component  44 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0015  Cbb3-type cytochrome oxidase component  48 
 
 		 54 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0732  Cbb3-type cytochrome oxidase component  48 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0430029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2113  Cbb3-type cytochrome oxidase component  47.92 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5232  Cbb3-type cytochrome oxidase component  47.92 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.346286  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5017  Cbb3-type cytochrome oxidase component  46 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, CcoQ subunit  40.43 
 
 		 52 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0377  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, CcoQ subunit  40.43 
 
 		 52 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0467  Cbb3-type cytochrome oxidase component  42.55 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000540469  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6266  Cbb3-type cytochrome oxidase component  44 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.496314  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5933  Cbb3-type cytochrome oxidase component  44 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404492  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0013  Cbb3-type cytochrome oxidase component  56.25 
 
 		 54 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>