13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3966 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3966  metallophosphoesterase  100 
 
 		 572 aa  1167    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3529  metallophosphoesterase  39.54 
 
 		 607 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3678  metallophosphoesterase  39.92 
 
 		 607 aa  363  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3121  metallophosphoesterase  30.07 
 
 		 609 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.996653  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5256  hypothetical protein  35.64 
 
 		 482 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.473407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4012  metallophosphoesterase  27.02 
 
 		 685 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4173  metallophosphoesterase  27.7 
 
 		 641 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4393  metallophosphoesterase  32.03 
 
 		 704 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  22.29 
 
 		 2701 aa  54.3  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.39 
 
 		 3977 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0118  metallophosphoesterase  34.02 
 
 		 312 aa  47.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  24.44 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  21.08 
 
 		 2852 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>