12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3529 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3529  metallophosphoesterase  100 
 
 
607 aa  1253    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3678  metallophosphoesterase  94.89 
 
 
607 aa  1176    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3121  metallophosphoesterase  38.09 
 
 
609 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.996653  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3966  metallophosphoesterase  39.54 
 
 
572 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4012  metallophosphoesterase  32.14 
 
 
685 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4173  metallophosphoesterase  34.04 
 
 
641 aa  344  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4393  metallophosphoesterase  33.23 
 
 
704 aa  313  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5256  hypothetical protein  34.23 
 
 
482 aa  250  6e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.473407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  23.26 
 
 
2852 aa  64.7  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0524  metallophosphoesterase  21.59 
 
 
721 aa  52.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  19.94 
 
 
3977 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  21.58 
 
 
2701 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>