23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3939 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  346  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  55.48 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  55.32 
 
 		 163 aa  163  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  55.32 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  45.24 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  46.1 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  36.3 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  33.13 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  31.14 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  40.41 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  39.36 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  30.28 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  38.3 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  29.48 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  28.48 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  29.58 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  32.52 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  30.36 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  30.61 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  26.96 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  26.96 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6516  hypothetical protein  46.51 
 
 		 58 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.131364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>