24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0065 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  353  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  99.41 
 
 
170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  74.38 
 
 
166 aa  245  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  71.07 
 
 
176 aa  238  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  71.94 
 
 
161 aa  205  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  63.36 
 
 
163 aa  167  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  38.96 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  32.45 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  34.97 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  36.65 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  50 
 
 
163 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  50 
 
 
163 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  36.99 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  45.21 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  32.84 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  33.81 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  28.48 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  33.81 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  47.89 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  29.93 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  29.93 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  32.05 
 
 
191 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6073  hypothetical protein  26.62 
 
 
314 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6516  hypothetical protein  44.68 
 
 
58 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.131364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>