24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0482 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  54.01 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  53.28 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  53.28 
 
 		 163 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  45.24 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  47.62 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  39.24 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  40.71 
 
 		 170 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  37.93 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  40.91 
 
 		 191 aa  87.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  37.01 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  32.45 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  32.45 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  32.08 
 
 		 175 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  36.99 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  34.93 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  38.24 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  34.01 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  33.55 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  33.56 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  29.25 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6073  hypothetical protein  31.54 
 
 		 314 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6516  hypothetical protein  53.49 
 
 		 58 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.131364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>