22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5318 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  343  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  85.31 
 
 
170 aa  257  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  52.94 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  55.03 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  55.03 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  53.85 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  38.27 
 
 
171 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  37.93 
 
 
161 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  41.88 
 
 
191 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  39.86 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  40.15 
 
 
163 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  38.36 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  36.11 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  37.68 
 
 
164 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  35.51 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  35.51 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  35.42 
 
 
170 aa  84  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  34.72 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  34.97 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  31.14 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  27.74 
 
 
189 aa  58.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  26.67 
 
 
198 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>