23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1796 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  354  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  86.44 
 
 
177 aa  290  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  86.44 
 
 
177 aa  290  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  54.6 
 
 
175 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  52.84 
 
 
174 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  50.35 
 
 
170 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  38.73 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  33.73 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  34.93 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  33.96 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  32.85 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  35.54 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  31.72 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  34.71 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  29.57 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  30.53 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  30.53 
 
 
163 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  29.91 
 
 
185 aa  57.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  26.05 
 
 
189 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6073  hypothetical protein  26.09 
 
 
314 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  29.81 
 
 
198 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>