22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2987 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2987  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8202  Phytochelatin synthase  60.65 
 
 		 217 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1537  phytochelatin synthase, putative  28.77 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00496705  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2562  primitive phytochelatin synthase  28.77 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.957443  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1307  putative phytochelatin synthase  28.77 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0059435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2416  putative phytochelatin synthase  28.77 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0257304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2036  putative phytochelatin synthase  28.77 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.058145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3276  putative phytochelatin synthase  28.77 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2472  putative phytochelatin synthase  28.77 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2045  phytochelatin synthase, putative  29.41 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000418313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10791  putative phytochelatin synthase-like protein  36.44 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2958  phytochelatin synthase  28.16 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1186  phytochelatin synthase-like protein  35.71 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1813  phytochelatin synthase-like protein  35.29 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3773  Phytochelatin synthase  27.89 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0547  phytochelatin synthase, putative  31.03 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2472  phytochelatin synthase-like  28.9 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48175  predicted protein  35.21 
 
 		 604 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50006  predicted protein  40.62 
 
 		 735 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1504  phytochelatin synthase  34.72 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0516  hypothetical protein  35.9 
 
 		 319 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.519264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5317  putative phytochelatin synthase  28.45 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>