24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0516 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0516  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  676    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.519264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3773  Phytochelatin synthase  33.33 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2958  phytochelatin synthase  34.18 
 
 		 239 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2045  phytochelatin synthase, putative  34.17 
 
 		 243 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000418313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2472  phytochelatin synthase-like  34.48 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1537  phytochelatin synthase, putative  34.05 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00496705  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1307  putative phytochelatin synthase  34.05 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0059435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3276  putative phytochelatin synthase  34.05 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2562  primitive phytochelatin synthase  34.05 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.957443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2036  putative phytochelatin synthase  34.33 
 
 		 347 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.058145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2416  putative phytochelatin synthase  34.33 
 
 		 354 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0257304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2472  putative phytochelatin synthase  32.76 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10791  putative phytochelatin synthase-like protein  33.05 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0547  phytochelatin synthase, putative  30.34 
 
 		 239 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5317  putative phytochelatin synthase  31.51 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1504  phytochelatin synthase  30.08 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1278  putative phytochelatin synthase  30.74 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1813  phytochelatin synthase-like protein  28.95 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.542547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48175  predicted protein  24.54 
 
 		 604 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9478  predicted protein  25.93 
 
 		 227 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50006  predicted protein  24.03 
 
 		 735 aa  69.7  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.415443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1186  phytochelatin synthase-like protein  25.1 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1630  hypothetical protein  28.21 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8202  Phytochelatin synthase  32.26 
 
 		 217 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.585772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>