19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2512 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2512  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 57 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.236986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2387  Flp/Fap pilin component  46 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0065262  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0223  component of type 4 pilus pilin subunit protein  44 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2332  Flp/Fap pilin component  35 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.341301  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2824  Flp/Fap pilin component  44.9 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7206  Flp/Fap pilin component  36.84 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0674219  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0653  Flp/Fap pilin component  41.18 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3349  Flp/Fap pilin component  54.76 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2710  pilin, putative  36.84 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7207  Flp/Fap pilin component  35.09 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150094  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4611  Flp/Fap pilin component  35.71 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.699189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0416  Flp/Fap pilin component  36.54 
 
 		 52 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2075  Flp/Fap pilin component  50 
 
 		 58 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.514501  normal  0.606618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2076  Flp/Fap pilin component  38.3 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.554715  normal  0.612928 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1439  Flp/Fap pilin component  32.76 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719822  normal  0.158207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1493  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000102149  hitchhiker  0.00000902291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1517  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000857927  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1037  Flp/Fap pilin component  33.33 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3825  Flp/Fap pilin component  44.23 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>