15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1677 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1727  hypothetical protein  40.5 
 
 		 114 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0257  hypothetical protein  40.5 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3793  hypothetical protein  42.27 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118675  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2749  hypothetical protein  39.78 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.448034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0278  hypothetical protein  46.99 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2159  hypothetical protein  31.85 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0189449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2299  hypothetical protein  31.85 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3599  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4150  hypothetical protein  35.63 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7412  hypothetical protein  35.23 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5565  hypothetical protein  36.56 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.123926 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1028  hypothetical protein  31.4 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.354619  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6264  hypothetical protein  36.56 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>