13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7412 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7412  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4150  hypothetical protein  77.45 
 
 		 123 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5565  hypothetical protein  67 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.123926 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4473  hypothetical protein  87.67 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255795  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2749  hypothetical protein  54.65 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.448034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1197  hypothetical protein  39.29 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00120009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1028  hypothetical protein  41.1 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.354619  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1727  hypothetical protein  37.37 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0257  hypothetical protein  39.8 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1677  hypothetical protein  35.23 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2159  hypothetical protein  31.78 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0189449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2299  hypothetical protein  31.78 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3793  hypothetical protein  31.68 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>