14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4150 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4150  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7412  hypothetical protein  77.45 
 
 		 113 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5565  hypothetical protein  65.35 
 
 		 104 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.123926 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4473  hypothetical protein  76 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255795  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2749  hypothetical protein  56.98 
 
 		 92 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.448034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1028  hypothetical protein  35.42 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.354619  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1197  hypothetical protein  36 
 
 		 279 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00120009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1677  hypothetical protein  35.63 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1727  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3793  hypothetical protein  30.69 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118675  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2159  hypothetical protein  28.04 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0189449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2299  hypothetical protein  28.04 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>