12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1727 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  234  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0257  hypothetical protein  48.28 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3793  hypothetical protein  52.83 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.118675  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2159  hypothetical protein  42.62 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0189449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2299  hypothetical protein  42.62 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1677  hypothetical protein  40.5 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3599  hypothetical protein  46.61 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0278  hypothetical protein  40.91 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2749  hypothetical protein  41.12 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.448034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7412  hypothetical protein  37.37 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5565  hypothetical protein  32.65 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.123926 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>