50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1244 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2726  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  57.89 
 
 		 266 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  57.36 
 
 		 266 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  56.23 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  52.65 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  52.09 
 
 		 273 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  52.12 
 
 		 273 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  51.16 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  50 
 
 		 264 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.5 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  47.71 
 
 		 264 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  46.96 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  47.15 
 
 		 288 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  49.39 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  51.24 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.39 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.31 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.31 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.31 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  43.32 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  42.29 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6740  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  58.33 
 
 		 195 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.515354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0248  putative streptomycin phosphotransferase  58.04 
 
 		 120 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2501  3''-kinase  35.71 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0129  aminoglycoside resistance protein B  34.3 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5338  streptomycin phosphotransferase  34.3 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1571  aminoglycoside resistance protein B  34.3 
 
 		 281 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.078076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0045  streptomycin resistance protein StrB  34.3 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2670  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.3 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0084  streptomycin phosphotransferase B  32.88 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.707576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1673  streptomycin resistance protein  32.73 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0003  streptomycin resistance protein, StrB  35.79 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.02 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.72 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.98 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  25 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.92 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  25 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  29.71 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  25.36 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  31.78 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  27.27 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.28 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.41 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.35 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  27.76 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  26.46 
 
 		 306 aa  52  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1410  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.67 
 
 		 331 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.189739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.04 
 
 		 303 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24730  streptomycin 6-kinase  29.15 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>