54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  100 
 
 
293 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.79 
 
 
267 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  45.52 
 
 
273 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  47.89 
 
 
265 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  44 
 
 
273 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2726  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.24 
 
 
266 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167772  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  43.46 
 
 
284 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.09 
 
 
264 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  45.49 
 
 
271 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.46 
 
 
264 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.85 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.85 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.85 
 
 
279 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  44.01 
 
 
288 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  43.23 
 
 
266 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.05 
 
 
271 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  43.31 
 
 
286 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  42.29 
 
 
272 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  44.62 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  42.5 
 
 
266 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  37.89 
 
 
270 aa  148  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6740  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  59.34 
 
 
195 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.515354 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0248  putative streptomycin phosphotransferase  46.34 
 
 
120 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2501  3''-kinase  29.89 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  35.82 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1673  streptomycin resistance protein  30.77 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0129  aminoglycoside resistance protein B  29.88 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974008  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1571  aminoglycoside resistance protein B  29.88 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.078076  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5338  streptomycin phosphotransferase  29.88 
 
 
278 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0045  streptomycin resistance protein StrB  29.88 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2670  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.88 
 
 
276 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.92 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0084  streptomycin phosphotransferase B  29.73 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.707576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  33.8 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.11 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0003  streptomycin resistance protein, StrB  30.32 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.56 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.46 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  26.01 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  28.52 
 
 
329 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  31.87 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  25.56 
 
 
468 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.2 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  24.91 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  38.53 
 
 
311 aa  53.1  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30370  streptomycin 6-kinase  27.3 
 
 
326 aa  52.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.27 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1410  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.14 
 
 
331 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.189739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1422  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.33 
 
 
373 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000015998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  28.21 
 
 
309 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  46.99 
 
 
285 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24730  streptomycin 6-kinase  27.7 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.13 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.449073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>