52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4780 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  96.85 
 
 		 286 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  77.48 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  76.9 
 
 		 279 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  76.9 
 
 		 279 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  76.9 
 
 		 279 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  69.31 
 
 		 300 aa  378  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  53.58 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  52.55 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  50.19 
 
 		 271 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  51.35 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  51.23 
 
 		 265 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  47.17 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  48.3 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2726  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.5 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  47.15 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  47.92 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  47.72 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  47.28 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  44.01 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  44.03 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0248  putative streptomycin phosphotransferase  61.16 
 
 		 120 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6740  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  48.12 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.515354 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1571  aminoglycoside resistance protein B  33.6 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.078076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5338  streptomycin phosphotransferase  33.6 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0129  aminoglycoside resistance protein B  33.6 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2670  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.6 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0045  streptomycin resistance protein StrB  33.6 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0084  streptomycin phosphotransferase B  33.06 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.707576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2501  3''-kinase  34.69 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1673  streptomycin resistance protein  35.11 
 
 		 288 aa  99  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  36.9 
 
 		 307 aa  99  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.94 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0003  streptomycin resistance protein, StrB  35.71 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.11 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  31.17 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  33.92 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.14 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  32.16 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  33.82 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.42 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  32.16 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  34.17 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  30.13 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  29.75 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.82 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.99 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  35.42 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.73 
 
 		 285 aa  52.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.74 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.449073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1410  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.68 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.189739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0327  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>