36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0843 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0843  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  425  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02470  hypothetical protein  49.77 
 
 
344 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.409751  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1363  hypothetical protein  40.69 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1298  hypothetical protein  40.69 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2405  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
246 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000054143  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  50 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  53.06 
 
 
272 aa  45.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  30.49 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2610  hypothetical protein  34.25 
 
 
248 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000632095  normal  0.867129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  34.44 
 
 
257 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1990  hypothetical protein  36.11 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000251541  hitchhiker  0.00000167474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  41.54 
 
 
274 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  46.15 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2562  hypothetical protein  40 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  27.08 
 
 
245 aa  41.6  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  33.67 
 
 
247 aa  41.6  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  44.9 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  43.14 
 
 
270 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  38 
 
 
245 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  38 
 
 
245 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  38 
 
 
245 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  38 
 
 
245 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175678  decreased coverage  0.0000300845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>