16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6554 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6554  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  338  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999117  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4966  hypothetical protein  64.52 
 
 
162 aa  217  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104499  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2354  hypothetical protein  53.5 
 
 
161 aa  180  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0296  hypothetical protein  46.45 
 
 
160 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249332  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1581  hypothetical protein  45.39 
 
 
166 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2632  hypothetical protein  44.37 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4583  hypothetical protein  35.44 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0174  hypothetical protein  34.19 
 
 
161 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3071  hypothetical protein  31.25 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4917  hypothetical protein  25.76 
 
 
152 aa  48.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2991  hypothetical protein  29.41 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1175  hypothetical protein  29.56 
 
 
168 aa  42  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693799  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2779  hypothetical protein  29.85 
 
 
163 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2728  hypothetical protein  29.85 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2986  hypothetical protein  29.85 
 
 
163 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000289028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2709  hypothetical protein  28.68 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.583486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>