18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2632 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2632  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797244 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1581  hypothetical protein  92.17 
 
 
166 aa  319  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4583  hypothetical protein  44.87 
 
 
162 aa  144  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254207  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6554  hypothetical protein  44.37 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999117  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4966  hypothetical protein  42.21 
 
 
162 aa  137  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104499  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0174  hypothetical protein  43.31 
 
 
161 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2354  hypothetical protein  40.25 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0296  hypothetical protein  40.52 
 
 
160 aa  123  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249332  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3071  hypothetical protein  23.31 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1175  hypothetical protein  30.63 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693799  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0683  hypothetical protein  27.1 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1351  hypothetical protein  25.62 
 
 
181 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2779  hypothetical protein  28.1 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2986  hypothetical protein  28.1 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000289028 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2990  hypothetical protein  27.27 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.129181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2728  hypothetical protein  28.1 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2709  hypothetical protein  27.27 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.583486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2784  hypothetical protein  29.27 
 
 
163 aa  40.8  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>