19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4966 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4966  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  333  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.104499  normal  0.177595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6554  hypothetical protein  64.52 
 
 
166 aa  217  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.999117  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2354  hypothetical protein  55.13 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0296  hypothetical protein  48.7 
 
 
160 aa  160  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249332  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1581  hypothetical protein  43.51 
 
 
166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2632  hypothetical protein  42.21 
 
 
166 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4583  hypothetical protein  39.61 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0174  hypothetical protein  37.42 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.275779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3071  hypothetical protein  29.22 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1175  hypothetical protein  29.11 
 
 
168 aa  51.2  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.693799  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2709  hypothetical protein  28.47 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.583486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2991  hypothetical protein  28.78 
 
 
163 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0683  hypothetical protein  28.1 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2779  hypothetical protein  28.06 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2986  hypothetical protein  28.06 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000289028 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2728  hypothetical protein  28.06 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2990  hypothetical protein  28.06 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.129181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2784  hypothetical protein  25.79 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4917  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>