15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2926 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2926  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 71 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6820  heavy metal transport/detoxification protein  62.16 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4949  hypothetical protein  61.54 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.638193  normal  0.129375 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6645  hypothetical protein  54.29 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.352702  normal  0.381791 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6874  hypothetical protein  56.34 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3057  hypothetical protein  55.22 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.726798  decreased coverage  0.000436786 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6891  hypothetical protein  47.95 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3107  hypothetical protein  51.47 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3327  hypothetical protein  41.18 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1498  hypothetical protein  44.78 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000455513  normal  0.0497856 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00265  hypothetical protein  38.81 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.898664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4798  hypothetical protein  41.79 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  37.04 
 
 		 70 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  35.48 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>